Летяга — Pteromys volans (Linneanus, 1758) — Flying Squirrel.
Семейство Беличьи — Sciuridae
Обыкновенная белка — Sciurus vulgaris Linneanus, 1758 — Red Squirrel.
Азиатский бурундук — Tamias sibiricus (Laxmann, 1769) — Siberian Chipmunk.
Семейство Тушканчиковые Dipodidae
Длиннохвостая мышовка Sicista caudata Thom. Long-tailed Birch Mouse
Полевая мышь — Apodemus agrarius (Pallas, 1771) — Striped Field Mouse.Типичный обитатель открытых стаций, преимущественно опушки, гари.
Азиатская мышь — Apodemus peninsulae (Thomas, 1906) — Korean Field Mouse.Многочисленный вид. Заселяет все типы леса.
Домовая мышь — Mus musculus Linneanus, 1758 — House Mouse.Синантропный вид. Поселяется в жилых и хозяйственных постройках заповедника.
Мышь-малютка — Micromys minutus (Pallas, 1711) — Harvest Mouse.
Серая крыса — Rattus norvegicus Berkkenhout, 1769 — Norway Rat.В естественных условиях обычный вид в нижних участках долин рек и морском побережье.
Черная крыса — Rattus rattus Linneanus, 1758 — Black Rat.В естественных биотопах отмечается только в летний период, проникая с хозяйственных построек сопредельной территории.
Семейство Хомяковые — Cricetidae
Ондатра — Ondatra zibethica (Linneanus, 1766) — Muskrat.В 1985 г. госпромхозом проведена неудачная попытка акклиматизации данного вида на сопредельной территории в оз.Селюшино, Топкое. В заповеднике вид не отмечен.
Красно-серая полевка — Clethrionomys rufocanus (Sundervall, 1846) — Grey-sided Vole.
Красная полевка — Clethrionomys rutilus (Pallas, 1799) — Northern Red-backed Vole.Обычный вид пихтово-еловых стаций, реже кедрово-широколиственных лесов.
Большая полевка — Microtus fortis Buchner, 1889 — Reed Vole.Типичный обитатель пойменных лесов, болот и лугов.