Achnanthes lanceolata (Breb.) Grun.Ключи, реки, нередко.
A. minutissima Kutz.Реки Лазовка и Киевка, редко.
A. nodosa A. Cl.Река Перекатная, редко.
Actinella brasilliensis Grun.Озеро Чухуненко, очень редко.
Amphiprora paludosa W. Sm.Протока Молдаванка, озера Заря и Чухуненко.
Amphora ovalis Kutz. var. ovalis.Озеро Чухуненко, очень редко.
Var. pediculus Kutz.Озеро Чухуненко, болотце, очень редко.
A. recta (Skv. et Meyer) Pr.-Lavr.Ключ Кедровый, редко.
A. veneta Kutz.Повсеместно единичными клетками.
Asterionella gracillima (Hantzsch.) Heib.Озеро Заря, нередко.
A. formosa Hass.Озеро Заря и Чухуненко, нередко.
Aulacosira granulata (Ehr.) Simonsen.Озера Заря и Чухуненко, нередко.
A. islandica (O. Mull.) Simonsen.Озера Заря и Чухуненко, часто.
A. italica (Ehr.) Simonsen.Повсеместно в стоячих и текучих водах, часто.
Bacillaria paradoxa Gmelin.Заболоченные участки в прибрежьях рек, очень редко.
Caloneis amphisbaena (Bory) Cl.Старицы, очень редко.
C. bacillum (Grun.) Mert.Повсеместно в стоячих водах, очень редко.
C. latiuscula (Kutz.) Cl.Болотце, очень редко.
C. silicula (Ehr.) Cl.Реки Перекатная и Глазковка, очень редко.
Ceratoneis arcus (Ehr.) Kutz. var. arcus.Ключ Кедровый, нередко; реки, ключи, заболоченные прибрежья, часто.
Var. linearis Holmboe. f. recta (Skv. et Meyer) Pr.-Lavr.Ключ Кедровый, редко.
Cocconeis pediculus Ehr.Реки Киевка, Перекатная, Соколовка, Глазковка, Лазовка, Проселочная, часто.
C. placentula Ehr.Реки Киевка и Лазовка, нередко.
Cyclotella meneghiniana Kutz.Река Лазовка, редко.
Cymatopleura solea (Breb.) W. Sm.Старицы, болота, нередко.
Cymbella aequalis W. Sm.Река Перекатная, очень редко.
C. affinis Kutz.Реки, часто.
C. aspera (Ehr.) Cl.Озеро Заря, река Целинка, редко.
C. cistula (Hemp.) Grun.Старицы, озера, болота, часто.
C. cuspidata Kutz.Болото, очень редко.
C. cymbiformis (Ag. ? Kutz.) V. H.Болота, заболоченные прибрежья рек, нередко.
C. delicatula Kutz.Озеро Чухуненко, очень редко.
C. hebridica (Greg.) Grun.Озеро Чухуненко, очень редко.
C. hybrida Grun.Старицы, болота, озера, часто.
C. lanceolata (Ehr.) V. H.Озеро Заря, очень редко.
C. naviculiformis Auersw.Болото, очень редко.
C. parva (W. Sm.) Cl.Болото, очень редко.
C. prostrata (Berk.) Cl.Старица, очень редко.
C. pusilla Grun.Старицы, нередко.
C. tumida (Breb.) V. H.Река Глазковка, очень редко.
C. tumidula Grun.Заболоченные прибрежья рек, редко.
C. turgida (Greg.) Cl.Заболоченные прибрежья рек, очень редко.
C. turgidula Grun.Реки Беневка и Соколовка, ключи Чащевитый и Дьяконовский, редко.
C. ventricosa Kutz. var. ventricosa.Повсеместно в реках и ключах, в массе.
Var. ovata Grun.Реки Лазовка и Соколовка, очень редко.
Diatoma anceps (Ehr.) Kirchn.Болото, очень редко.
D. elongatum (Lyngb.) Ag.Болото, очень редко.
D. hiemale (Lyngb.) Heib. var. hiemale.Ключ Дьяковский, редко.
Var. mesodon (Ehr.) Grun.Ключ Парамоновский, редко.
D. vulgare Bory. var. vulgare.Повсеместно, часто.
Var. breve Grun.Повсеместно в реках и ключах, нередко.
Var. lineare Grun.Река Перекатная, очень редко.
Var. ovale (Fricke) Hust.Река Перекатная, очень редко.
Didymosphenia geminata (Lyngb.) M. Schm.Река Лазовка, очень редко.
Diploneis boldtiana Cl.Озеро Чухуненко, очень редко.
D. elliptica (Kutz.) Cl.Озеро Чухуненко, очень редко.
Epithemia argus Kutz.Озеро Заря, очень редко.
E. zebra (Ehr.) Kutz. var. zebra.Старицы, болота, озера, нередко.
Var. porcellus (Kutz.) Grun.Озеро Чухуненко, очень редко.
Eunotia alpina (Nag.) Hust.Болото, очень редко.
E. bigibba Kutz. var. bigibba.Болото, очень редко.
Var. pumila Grun.Болото, очень редко.
E. diodon Ehr.Озеро Заря, старицы, болота, нередко.
E. exiqua (Breb.) Rabenh.Болото, очень редко.
E. fallax Cl.Болото, очень редко.
E. gracilis (Ehr.) Rabenh.Озера Заря и Чухуненко, старицы, болота, часто.
E. lunaris (Ehr.) Grun.Повсеместно, часто.
E. pectinaris (Villw. ? Kutz.) Rabenh. var. pectinalis.Болото, очень редко.
Var. minor (Kutz.) Rabenh.Болото, очень редко.
Var. ventralis (Ehr.) Hust.Болото, очень редко.
E. polydentula Brun.Озеро Заря, болото, редко.
E. praerupta Ehr.Болото, очень редко.
E. robusta Ralfs var. robusta.Старицы, болота, нередко.
Var. tetraodon (Ehr.) Ralfs.Болото, очень редко.
E. septentrionalis Ostr.Ключ Лянгуева падь, реки, нередко.
E. tauntoniensis Hust.Старицы, очень редко.
E. tenella (Grun.) Hust.Болото, очень редко.
E. triodon Ehr.Болото, очень редко.
Fragilaria capucina Desm.Реки Лазовка, Киевка, Проселочная, нередко.
F. construens (Ehr.) Grun. var. construens.Река Перекатная, очень редко.
Var. binodis (Ehr.) Grun.Реки Лазовка, Киевка, редко.
F. crotonensis Kitt.Река Киевка, нередко.
F. intermedia Grun.Река Лазовка, заводь, редко.
F. virescens Ralfs.Реки Киевка, Лазовка, Перекатная, часто.
Frustulia rhomboides (Ehr.) D. T.Ключ Дьяковский, редко.
F. vulgaris Thw. var. capitata Krasske.Ключ Безымянный, редко.
Gomphonema abbreviatum Ag. ? Kutz.Болото, очень редко.
G. acuminatum Ehr. var. acuminatum.Повсеместно, нередко.
Var. brebissonii (Kutz.) Cl.Старицы, болота, нередко.
Var. coronatum (Ehr.) W. Sm.Озера Заря и Чухуненко, старицы, болота, часто.
G. augur Ehr. var. augur.Болота, нередко.
Var. gautieri V. H.Ключ Еламовский, река Киевка, озеро Заря, редко.
G. constrictum Ehr. var. constrictum.G. constrictum Ehr. var. constrictum.
Var. capitatum (Ehr.) Cl.Озеро Заря, очень редко.
G. intricatum Kutz. var. dichotomum (Kutz.) Grun.Озеро Заря, очень редко.
G. longiceps Ehr. var. longiceps.Заболоченные прибрежья рек, нередко.
Var. subclavatum Grun.Заболоченные прибрежья рек, нередко.
G. olivaceum (Lyngb.) Kutz.Повсеместно, нередко.
G. parvulum (Kutz.) Grun. var. parvulum.Повсеместно, очень часто.
Var. subellipticum Cl.Река Лазовка, очень редко.
G. subtile Ehr.Озеро Заря, очень редко.
G. transilvanicum Pant.Озеро Чухуненко, очень редко.
Gyrosigma acuminatum (Kutz.) Rabenh.Старицы, редко.
Hantzschia amphioxys (Ehr.) Grun. f. amphioxys.Река Киевка, редко.
F. capitata O. Mull.Болота, старицы, нередко.
H. elongata (Hantzsch) Grun.Болото, очень редко.
Melosira varians Ag.Повсеместно в реках, часто.
Meridion circulare Ag. var. circulare.Повсеместно, нередко.
Var. constrictum (Ralfs) V.H.Повсеместно в реках, старицах, часто.
Navicula atomus (Nag.) Grun.Болото, очень редко.
N. bacilliformis Grun.Болота, нередко.
N. bacillum Ehr.В реках и ключах, в массе.
N. cryptocephala Kutz.Река Лазовка, очень редко.
N. cuspidata Kutz.Заболоченные прибрежья рек, редко.
N. dicephala (Ehr.) W. Sm.Старицы, очень редко.
N. diluviana Krasske.Озеро Чухуненко, очень редко.
N. exiqua (Greg.) O. Mull.Болота, нередко.
N. gastrum Ehr. var. hankensis Skv.Старица, очень редко.
N. gracilis Ehr.Повсеместно в стоячих водах, нередко.
N. halophila (Grun.) Cl.Реки Соколовка и Перекатная, старицы, очень редко.
N. hasta Pant.Озеро Чухуненко, очень редко.
N. hungarica Grun. var. capitata Cl.Старицы, болота, нередко.
N. lambda Cl.Озеро Заря, очень редко.
N. minusculus Schum.Озеро Чухуненко, очень редко.
N. pupula Kutz. var. pupula.Старицы, болота, нередко.
Var. capitata Hust.Повсеместно в стоячих водах, часто.
N. radiosa Kutz.Болота, нередко.
N. rhynchocephala Kutz.Старицы, очень редко.
N. salinarum Grun.Озеро Чухуненко, очень редко.
N. simplex Krasske.Старицы, болота, нередко.
N. tuscula (Ehr.) Grun.Озеро Чухуненко, очень редко.
N. viridula Kutz.Река Лазовка, очень редко.
Neidium affine (Ehr.) Cl. var. amphirhynchus (Ehr.) Cl. f. undulatum Hust.Озеро Заря, очень редко.
N. dubium (Ehr.) Cl.Озеро Заря, очень редко.
N. iridis (Ehr.) Cl. var. amphigomphus (Ehr.) V. H.Болото, очень редко.
N. productum (W. Sm.) Cl.Болото, очень редко.
Nitzschia acicularis W. Sm.Все реки, нередко.
N. amphicephala Grun.Река Киевка, очень редко.
N. angularis W. Sm.Река Перекатная, очень редко.
N. apiculata (Greg.) Grun.Река Глазковка, очень редко.
N. distans Greg.Реки Перекатная, Киевка и Проселочная, очень редко.
N. dubia W. Sm.Озеро Заря, очень редко.
N. hungarica Grun.Река Киевка, нередко.
N. kuetzingiana Hilse.Повсеместно, нередко.
N. linearis W. Sm.Старицы, болота, нередко.
N. lorenziana Grun. var. incurva Grun.Река Русаковка, озеро Заря, очень редко.
N. obtusa W. Sm. var. obtusa.Старицы, болота, нередко.
Var. scalpelliformis Grun.Река Русаковка, болото, очень редко.
N. palea (Kutz.) W. Sm. var. palea.Река Киевка, очень редко.
Var. capitata Wisl. et Poretzky.Река Киевка, очень редко.
N. paleaceae Grun.Река Лазовка, очень редко.
N. sigma (Kutz.) W. Sm.Болото, редко.
N. sigmoidea (Ehr.) W. Sm.Старицы, болота, нередко.
N. thermalis Kutz. var. thermalis.Реки, нередко.
Var. minor Hilse.Реки, нередко.
N. tryblionella Hantzsch. var. levidensis (W. Sm.) Grun.Озеро Заря, очень редко.
Var. victoriae Grun.Озеро Заря, очень редко.
N. vermicularis (Kutz.) Grun.Болото, очень редко.
Pinnularia borealis Ehr. var. brevicostata Hust.Болото, очень редко.
P. dactylus Ehr.Озеро Чухуненко, очень редко.
P. gibba Ehr. var. gibba.Повсеместно в заболоченных биотопах, часто.
Var. linearis Hust.Болото, очень редко.
Var. mesogongyla (Ehr.) Hust.Повсеместно в бентосе, часто.
P. interrupta W. Sm. f. interrupta.Повсеместно в заболоченных биотопах, нередко.
F. minor Boye-Pet.Болото, очень редко.
F. minutissima Hust.Старицы, болота, нередко.
P. leptosoma Grun.Озеро Чухуненко, очень редко.
P. macilenta (Ehr.) Cl.Река Лазовка, очень редко.
P. major (Kutz.) Cl. var. major.В реках и ручьях, часто.
Var. lacustris Meist.Река Киевка, очень часто.
P. mesolepta (Ehr.) W. Sm.Повсеместно в заболоченных биотопах, нередко.
P. microstauron (Ehr.) Cl.Повсеместно, нередко.
P. molaris Grun.Ключ Лянгуева падь, река Перекатная, редко.
P. subcapitata Greg.Болото, очень редко.
P. tabellaria Ehr.Болото, очень редко.
P. undulata Greg.Болото, очень редко.
P. viridis (Nitzsch) Ehr. var. viridis.Повсеместно, часто.
Var. leptogongyla (Ehr. ? Grun.) Cl.Болото, очень редко.
Rhizosolenia eriensis H.L. Sm.Озеро Заря, очень часто.
Rhoicosphenia curvata (Kutz.) Grun.Река Лазовка, очень редко.
Rhopalodia gibba (Ehr.) O. Mull. var. gibba.Озеро Чухуненко, старицы, болота, нередко.
Var. ventricosa (Ehr.) Grun.Озеро Чухуненко, очень редко.
Stauroneis anceps Ehr. f. anceps.Озеро Чухуненко, старицы, болота, нередко.
F. gracilis (Ehr.) Cl.Озеро Чухуненко, редко.
S. montana Krasske.Озеро Чухуненко, редко.
S. phoenicenteron Ehr.Озеро Чухуненко, старицы, болота, часто.
Stenopterobia intermedia Lewis. var. capitata Font.Болото, редко.
Stephanodiscus astraea (Ehr.) Grun.Озеро Заря, редко.
Synedra acus Kutz.Все реки, нередко.
S. goulardii (Breb.) Hust. var. goulardii.Река Киевка, редко.
Var. telezkoesis Poretzky.Ключи Большой и Парамоновский, редко.
S. minuscula Grun.Река Перекатная, очень редко.
S. tabulata (Ag.) Kutz. var. tabulata.Все реки, нередко.
Var. parva (Kutz.) Grun.Реки Лазовка и Киевка, редко.
S. ulna (Nitzsch.) Ehr. var. ulna.Повсеместно, часто.
Var. aequalis (Kutz.) Hust.Река Проселочная, редко.
Var. amphirhynchus (Ehr.) Grun.Река Проселочная, редко.
Var. contracta Ostr.Реки Проселочная и Лазовка, редко.
Surirella angustata Kutz.Реки, старицы, нередко.
S. biseriata Breb. var. biseriata.Старицы, болота, нередко.
Var. bifrons (Ehr.) Hust.Болото, очень редко.
S. capronii Breb.Старицы, нередко.
S. ovata Kutz. var. ovata.Реки Киевка и Лазовка, нередко.
Var. pinnata (W. Sm.) Hust.Река Киевка, очень редко.
S. robusta Ehr.Болото, очень редко.
S. tenera Greg.Болота, редко.
Tabellaria fenestrata (Lyngb.) Kutz. var. fenestrata.Повсеместно, часто.
Var. intermedia Grun.Повсеместно в реках, часто.
T. flocculosa (Roth) Kutz.Повсеместно, часто.